Apprentissage profond pour l’épidémiologie moléculaire

Des chercheurs ont publié dans Nature Communications un article portant sur l’utilisation de l’apprentissage profond (deep learning) pour quantifier la dynamique des flambées épidémiques, à partir de phylogénies de souches pathogènes prélevées dans la population hôte. La difficulté des modèles imposait jusqu’alors des calculs complexes et des données limitées. Ici, un réseau de neurones est utilisé pour apprendre à prédire en quelques secondes les paramètres épidémiologiques, à partir de simulations.

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